Es habitual, en sitios como The Pirate Bay, encontrar Magnet Links para descargar los torrents. La mayoría de los clientes de torrent funcionan con este tipo de enlaces, pero los navegadores no los interpretan, al clickar en principio no saben qué hacer, no los descargan automáticamente. Sólo necesitas seguir una serie de pasos simples para poder arreglar esto:
Lo primero, en Firefox, escribes about:config en la barra de direcciones. Te va a dar un aviso, acepta. Haciend click derecho tienes un menú donde eliges Nuevo->Booleano.

Como ves en la foto te pedirá un nombre, le pones network.protocol-handler.expose.magnet y tira p’alante. Luego te pedirá un valor, le metes False. El ponerlo como False hará que Firefox pregunte qué software se utilizará. Generalmente los clientes de P2P están en la carpeta /usr/bin así que mirad alli y seleccionad. Por defecto Ubuntu ya trae preinstalado el cliente Transmission, pero podéis buscar otro si no os gusta, hay múltiples opciones.