Conexión con base de datos SQLite en el lenguaje R

El lenguaje de programación R es tremendamente popular entre los matemáticos por estar desarrollado enfocado al análisis estadístico y por ser software libre (licencia GNU/GPL). Y siendo un lenguaje orientado a la estadística la lógica nos dicta que tiene que ser posible conectar con una base de datos.

Por suerte se han desarrollado librerías que sirven como interfaz para trabajar con la mayoría de los sistemas gestores de bases de datos más populares del mercado: SQL-Server, MySQL, PosgreSQL, Oracle y el caso que hoy nos ocupa, SQLite. Principalmente dispones de tres librerías para estas conexiones: ODBC (un standar desarrollado por Microsoft), DBI (basado en DBI de Perl y adaptado de forma nativa para R) y dplyr (otra aproximación nativa profundamente integrada). En este artículo vamos a ver cómo hacerlo con DBI, puesto que es la solución que me han recomendado más programadores de R veteranos.

El primer paso, claro, será instalar los paquetes de la librerías necesarias:

install.packages(c("DBI", "RSQLite"))

Y una vez instalados lo siguiente simplemente es añadir las librerías a nuestro código y configurar una conexión:

library(DBI)
library(RSQLite)

# Definimos el driver
driver <- dbDriver("SQLite")

#realizamos la conexión con dbConnect()
#Esta función recibe como primer parámetro el driver o un objeto
#de conexión ya existente, y como segundo parámetro todos los
#parámetros de conexión que requiere nuestra base de datos.
#SQLite solo necesita la ruta al fichero de la base de datos
#Otros SGBD necesitarán más
archivo_sqlite <- system.file("home/database.sqlite")

conexion <- dbConnect(driver, archivo_sqlite)

#Pdemos ejecutar consultas con dbSendQuery()
#la función recibe el objeto conexión y una consulta SQL.
resultado <- dbSendQuery(conexion, "SELECT * FROM baseDatosEjemplo")

#Para cerrar la conexión con la base de datos
dbDisconnect(conexion)
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